Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn34c1Q8K193 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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