Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrit1Q8K099 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrit1Q8K099 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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