Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC7

Klre1, Killer cell lectin-like receptor subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klre1Q8CJC7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Klre1Q8CJC7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Klre1Q8CJC7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms