Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf628Q8CJ78 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Znf628Q8CJ78 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf628Q8CJ78 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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