Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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SbsnQ8CIT9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SbsnQ8CIT9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms