Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim32Q8CH72 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms