Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Upp2Q8CGR7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Upp2Q8CGR7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms