Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Brf1Q8CFK2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Brf1Q8CFK2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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