Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Hpf1Q8CFE2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms