Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cdkl1Q8CEQ0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms