Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp27Q8CEG8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Usp27Q8CEG8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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