Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nlrp4bQ8C6J9 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Nlrp4bQ8C6J9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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