Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ubqln3Q8C5U9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ubqln3Q8C5U9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms