Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SowahcQ8C0J6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SowahcQ8C0J6 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms