Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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Usp47Q8BY87 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp47Q8BY87 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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