Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tnfsfm13Q8BXS2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnfsfm13Q8BXS2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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