Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ubash3bQ8BGG7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms