Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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H2-M10.4Q85ZW8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms