Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srgap3Q812A2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srgap3Q812A2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms