Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim19Q80ZU4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms