Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ell3Q80VR2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms