Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrc1Q80VQ1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms