Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pnma8aQ80VM8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms