Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sgo2Q7TSY8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sgo2Q7TSY8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms