Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Dsg1bQ7TSF1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dsg1bQ7TSF1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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