Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LnpkQ7TQ95 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LnpkQ7TQ95 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms