Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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