Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nphp3Q7TNH6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp3Q7TNH6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms