Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smap2Q7TN29 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smap2Q7TN29 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms