Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Eci3Q78JN3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms