Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx13Q6PHS6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms