Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SvoplQ6PDF3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms