Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zbtb40Q6PCS8 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zbtb40Q6PCS8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Zbtb40Q6PCS8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zbtb40Q6PCS8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zbtb40Q6PCS8 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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