Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
BC061212Q6P8K3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms