Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Krt77Q6IFZ6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Krt77Q6IFZ6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Krt77Q6IFZ6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Krt77Q6IFZ6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Krt77Q6IFZ6 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt77Q6IFZ6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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