Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atp11bQ6DFW5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Atp11bQ6DFW5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atp11bQ6DFW5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Atp11bQ6DFW5 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atp11bQ6DFW5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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