Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Q6DFW0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms