Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PtprjQ64455 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PtprjQ64455 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms