Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gja3Q64448 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms