Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tbr1Q64336 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tbr1Q64336 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms