Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Trim24Q64127 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Trim24Q64127 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms