Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
SnrpcQ62241 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms