Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim27Q62158 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms