Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Phox2aQ62066 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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