Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CttnQ60598 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CttnQ60598 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms