Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trim38Q5SZ99 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim38Q5SZ99 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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