Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Vmo1Q5SXG7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vmo1Q5SXG7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms