Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rnf215Q5SPX3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf215Q5SPX3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms