Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Fam208bQ5DTT3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Fam208bQ5DTT3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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