Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTM8

Rnf20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, mousemouse

Predictions only

Length 973 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf20Q5DTM8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf20Q5DTM8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf20Q5DTM8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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